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依據患者的流行病學史，臨床表現及實驗室檢查結果的綜合判斷進行診斷，確診須有血清學或病原學檢查結果。

(一)流行病學史

發病在EHF疫區及流行季節，或病前兩月內有疫區旅居史，或病前兩月內有與鼠類或其排泄物(尿、糞)/分泌物(唾液)直接或間接接觸史。

(二)臨床表現

1．早期癥狀和體征：起病急，發冷，發熱(38℃以上)；全身酸痛，乏力，呈衰竭狀；頭痛，眼眶痛，腰痛(三痛)；面、頸、上胸部充血潮紅(三紅)，呈酒醉貌；眼瞼浮腫，結膜充血水腫，有點狀或片狀出血；上腭粘膜呈網狀充血，點狀出血；腋下皮膚有線狀或簇狀排列的出血點；束臂試驗陽性。

2．病程經過：典型病例有發熱期、低血壓期、少尿期、多尿期和恢復期五期經過。前三期可有重疊。

(三)實驗室檢查

1．血檢查：早期白細胞數低或正常，3~4病日后明顯增多，桿狀核細胞增多，出現較多的異型淋巴細胞；血小板明顯減少；

2．尿檢查：尿蛋白陽性，并迅速加重，伴顯微血尿、管型尿；

3．血清特異性IgM抗體陽性；

4．恢復期血清特異性IgG抗體比急性期有4倍以上增高(注：有人主張IgG抗體滴度達1：320，結合臨床表現及流行病學史，亦可確診本病)；

5．從病人血液白細胞或尿沉渣細胞檢查到漢灘病毒(或EHF)抗原或病毒RNA。

(四)病例分類

1．疑似病例：具備(一)及(二)1；

2．臨床診斷病例：疑似病例加(二)2，(三)1，(三)2；

3．確診病例：疑似病例或臨床診斷病例加(三)3， (三)4， (三)5中的任一項。